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Journal of Infectious Diseases国家中心团结华大基因:乐成绘制HIV-1/Mtb共熏染人群肺脏“区域”免疫图谱

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2024年2月27日,国家熏染性疾病临床研究中心/深圳市第三人民医院张国良、卢水华团队,团结深圳华大基因吴靓团队、广西胸科医院刘爱梅团队,使用单细胞测序手艺乐成绘制HIV-1/Mtb共熏染人群肺脏“区域”免疫图谱,为深入剖析HIV-1熏染人群结核发病的免疫机制涤讪理论基石 。相关研究效果揭晓在美国熏染病学会(IDSA)旗下杂志Journal of Infectious Diseases,题为“Uncovering the Bronchoalveolar Single-Cell Landscape of Patients With Pulmonary Tuberculosis With Human Immunodeficiency Virus Type 1 Coinfection”(DOI:10.1093/infdis/jiae042) 。 

HIV-1熏染是导致结核发病的最主要危险因素 。由于临床样本收罗方面的挑战,大大都宿主抗结核免疫的研究主要集中在外周血,而外周血主要反应全身免疫反应,不可真实的反应出肺部的“区域”免疫特征 。肺部区域免疫应答关于阻止结核分枝杆菌的生长和避免疾病的希望至关主要,对肺部区域免疫应答的周全剖析关于更好地相识HIV-1/Mtb合并熏染的发病机制至关主要 。本研究共招募肺结核(TB)患者和HIV-1/Mtb共熏染患者,通过支气管镜手艺网络患者的肺泡灌洗液(BALF),并连忙举行单细胞疏散 。使用华大自主研发的便携式DNBeLab C4单细胞处置惩罚系统对举行单细胞转录组文库制备,并在华大自主研发的测序仪DIPSEQ T1上举行测序 。 

该研究通过单细胞测序手艺详细描绘了HIV-1/Mtb共熏染和纯粹TB患者肺泡灌洗液中的免疫细胞图谱 。进一步凭证差别表达的标识基因,将髓系细胞和T/NK细胞划分细分为10个细胞亚群 。研究发明HIV-1熏染显著降低结核患者肺部CD4+ T细胞和DCs细胞的比例,但显著提高CD8+ T细胞的比例 。同时该研究批注HIV-1/Mtb共熏染患者中的T细胞体现出更强的抗病毒活性,批注HIV-1熏染不但影响结核患者肺部免疫细胞亚群的漫衍特征,更影响免疫细胞的效应功效 。 

该研究获得国家重点研发妄想、国家自然科学基金、广东省特支妄想、深圳市科技妄想以及广西省科技妄想的支持 。国家熏染性疾病临床医学研究中心/深圳市第三人民医院肖国辉副研究员,华大基因黄外东、钟裕博士,深圳市第三人民医院欧敏助理研究员为本文配合第一作者 。


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