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斑马鱼胚胎具有通体透明特点 ，适于光学显微镜下的活体视察。光片显微手艺（Light-sheet microscopy）是一种新型的三维成像方法 ，具有光毒性小、扫描速率快等特点。针对斑马鱼、线虫等毫米级模式生物 ，光片成像需重大的样品准备流程 ，且由于视场限制 ，获得全胚胎的三维数据往往需要多区域成像与拼接 ，一条受精后3天左右的斑马鱼整个三维成像约莫需要15分钟左右 ，限制了该手艺的成像通量。
对此 ，中国科学院苏州医学工程手艺研究所李辉课题组、上海营养与康健研究所潘巍峻课题组相助 ，提出基于流式光片的高通量显微成像手艺LS-FIS（light-sheet flow imaging system）。LS-FIS立异性地将流式成像手艺与光片照明手艺相团结 ，通过设计液流与光学耦合系统 ，团结细密的进取样控制时序与三维重修算法 ，实现200胚胎/小时的高通量三维成像。
使用该手艺 ，研究职员举行了斑马鱼躯干及头部血管发育研究 ，统计并剖析了受精后3到9天的斑马鱼节间血管三维长度及眼部晶状体血管网形态转变。实验共获得凌驾500条全胚胎斑马鱼三维图像 ，这是现在已知首次报道的大规模全鱼三维成像数据。
别的 ，研究职员进一步开发了相关的图像剖析处置惩罚算法 ，以应对LS-FIS拍摄到的大宗三维图像数据自动化剖析处置惩罚的需求。针对斑马鱼节间血管 ，提出一种多标准特征的三维卷积神经网络（MS-3D U-Net） ，通过多标准特征学习和基于硬注重力机制的损失函数 ，实现对三维图像的血管支解和识别 ，识别准确度抵达90%以上（AUC值）�；贛S-3D U-Net ，对24小时一连视察的斑马鱼胚胎三维图像数据举行自动支解处置惩罚和丈量 ，绘制了节间血管和背侧纵向吻合血管的发育曲线。
相关效果揭晓于Biomedical Optics Express。
高通量三维成像系统LS-FIS的原理图和针对上百条斑马鱼3-9天血管发育历程的统计研究
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